Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rb1cc1Q9ESK9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms