Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrnb2Q9ERK7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms