Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH4

Taf8, Transcription initiation factor TFIID subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf8Q9EQH4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms