Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf21Q9EPU5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf21Q9EPU5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf21Q9EPU5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf21Q9EPU5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf21Q9EPU5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf21Q9EPU5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf21Q9EPU5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf21Q9EPU5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf21Q9EPU5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf21Q9EPU5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf21Q9EPU5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf21Q9EPU5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf21Q9EPU5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf21Q9EPU5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf21Q9EPU5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf21Q9EPU5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf21Q9EPU5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf21Q9EPU5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf21Q9EPU5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf21Q9EPU5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms