Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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Smg9Q9DB90 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Smg9Q9DB90 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Smg9Q9DB90 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Smg9Q9DB90 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Smg9Q9DB90 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Smg9Q9DB90 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Smg9Q9DB90 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Smg9Q9DB90 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Smg9Q9DB90 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Smg9Q9DB90 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms