Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Fundc1Q9DB70 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fundc1Q9DB70 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms