Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx5Q9D8U8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms