Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tvp23bQ9D8T4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms