Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C6

Med11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med11Q9D8C6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Med11Q9D8C6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med11Q9D8C6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med11Q9D8C6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med11Q9D8C6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med11Q9D8C6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med11Q9D8C6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med11Q9D8C6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med11Q9D8C6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med11Q9D8C6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med11Q9D8C6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med11Q9D8C6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med11Q9D8C6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med11Q9D8C6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med11Q9D8C6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms