Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn9Q9D805 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms