Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptp4a3Q9D658 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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