Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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