Protein–RNA interactions for Protein: Q9D593

Atp6v1e2, V-type proton ATPase subunit E 2, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v1e2Q9D593 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6v1e2Q9D593 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms