Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1Q9D495 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms