Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfap53Q9D439 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms