Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
4933428M09RikQ9D3X3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms