Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpn3Q9D3W4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms