Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Krt20Q9D312 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Krt20Q9D312 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Krt20Q9D312 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Krt20Q9D312 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Krt20Q9D312 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Krt20Q9D312 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Krt20Q9D312 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Krt20Q9D312 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt20Q9D312 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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