Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms