Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ift27Q9D0P8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ift27Q9D0P8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ift27Q9D0P8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ift27Q9D0P8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ift27Q9D0P8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ift27Q9D0P8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ift27Q9D0P8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ift27Q9D0P8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ift27Q9D0P8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ift27Q9D0P8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ift27Q9D0P8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ift27Q9D0P8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ift27Q9D0P8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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