Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms