Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Tmed5Q9CXE7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Tmed5Q9CXE7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Tmed5Q9CXE7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Tmed5Q9CXE7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms