Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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