Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sppl3Q9CUS9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms