Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Smurf1Q9CUN6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Smurf1Q9CUN6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Smurf1Q9CUN6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Smurf1Q9CUN6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Smurf1Q9CUN6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Smurf1Q9CUN6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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