Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms