Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931417E11RikQ9CR05 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms