Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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