Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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