Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101 ms