Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.5 ms