Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms