Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ska1Q9CPV1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms