Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn6Q99PL6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ubxn6Q99PL6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ubxn6Q99PL6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ubxn6Q99PL6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn6Q99PL6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn6Q99PL6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn6Q99PL6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn6Q99PL6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn6Q99PL6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn6Q99PL6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn6Q99PL6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn6Q99PL6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn6Q99PL6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn6Q99PL6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn6Q99PL6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn6Q99PL6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms