Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI4

Lpin3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpin3Q99PI4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lpin3Q99PI4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lpin3Q99PI4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms