Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab27bQ99P58 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms