Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cep41Q99NF3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep41Q99NF3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms