Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pcgf6Q99NA9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcgf6Q99NA9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms