Protein–RNA interactions for Protein: Q99N96

Mrpl1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl1Q99N96 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl1Q99N96 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms