Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms