Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms