Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcf2Q99LE6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms