Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep3Q99KK1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms