Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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