Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ddb2Q99J79 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms