Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms