Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms