Protein–RNA interactions for Protein: Q923S6

Neurl1, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1Q923S6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Neurl1Q923S6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1Q923S6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1Q923S6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1Q923S6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1Q923S6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1Q923S6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1Q923S6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1Q923S6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1Q923S6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1Q923S6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1Q923S6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1Q923S6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1Q923S6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1Q923S6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1Q923S6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1Q923S6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1Q923S6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1Q923S6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1Q923S6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1Q923S6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1Q923S6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1Q923S6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1Q923S6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1Q923S6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1Q923S6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1Q923S6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1Q923S6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1Q923S6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1Q923S6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1Q923S6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1Q923S6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1Q923S6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms