Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms