Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8VDP2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8VDP2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8VDP2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8VDP2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8VDP2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8VDP2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8VDP2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8VDP2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8VDP2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8VDP2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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